Dosadašnji generalni sekretar Ministarstva odbrane Mohamed Farid Hegazi zamenio je Mahmuda Hegazija na mestu načelnika Generalštaba moćne egipatske vojske. Mahmud Hegazi je postavljen za savetnika predsednika Sisija za strateško planiranje i upravljanje krizama. Blizak predsedniku, s kojim je povezan brakom među njihovom decom, Mahmud Hegazi je od marta 2014. godine bio i na položaju šefa vojne obaveštajne službe. On se upravo vratio iz Vašingtona gde je bio na sastanku vojnih lidera zemalja koje su uključene u borbu protiv terorizma. Njegovo smenjivanje je prvavelika promena od dolaska predsednika Sisija na vlast, takođe pripadnika vojske.
Jula 2013, Abdel Fatah Al-Sisi koji je bio načelnik Generalštaba i ministar odbrane, objavio je da je vojska smenila izabranog predsednika Egipta, islamistu Mohameda Morsija.
Od tada se egipatske oružane snage bore s nekoliko ekstremističkih grupa, posebno u regionu severnog Sinaja, na istoku zemlje. Posebno je aktivna grupa “Pokrajina Sinaj”, koja je 2014. godine obećala vernost džihadističkoj organizaciji Islamska država. Stotine vojnika i policajaca su poginule u napadima esktremista. Najnoviji se dogodio 20. oktobra u Zapadnoj pustinji, 200 kilometara jugozapadno od Kaira, gde je poginulo 16 policajaca.