Šezdesetogodišnji Šalja je proglašen krivim po tri tačke optužnice koje su ga teretile za proizvoljno lišavanje slobode, mučenje i ubistvo pritvorenika, kosovskih Albanaca, u improvizovanom pritvoru OVK u fabrici metala u Kukešu, izmedju 17. maja i 5. juna 1999.
Ta krivična dela kvalifikovana su kao ratni zločin povezan sa unutrašnjim sukobom na Kosovu.
„Više, više“, uzviknuo je Šalja pošto mu je sudija Mapi Feld Folja izrekla kaznu, a nastavio je da viče i pošto mu je sudija isključila mikrofon.
Šalja je osudjen da je lično i kao član zločinačkog udruženja učestvovao u proizvoljnom lišavanju slobode, mučenju „najmanje 18 pritvorenika“ i ubistvu jednog od njih.
Svi su bili Albanaci koje je OVK proglasila za „kolaborante“ sa srpskim vlastima, „izdajnike“, „simpatizere Srba“ ili da nisu podržavali OVK u dovoljnoj meri.
U pritvoru u Hagu, Šalja je od leta 2021. kada je bio uhapšen u Belgiji, čiji je državljanin.